1、遗传因素：相关研究显示，遗传因素是导致孩子自闭症的主要原因。单卵双生儿自闭症的一致性为90%以上，双卵一致性为24%。本症患儿的同胞患自闭症较正常人高3～4倍，提示本症与遗传因素相关。20%的小儿自闭症者中，他的家族可找到有智能不足、语言发展迟滞和类似小儿自闭症的。此外，小儿自闭症男童中约10%有染色体脆弱症。

2、认知缺陷因素：有人提出了认知功能与社会功能相关的学说，认为心理认知缺陷损害了自闭症患儿对他人精神状态的理解能力，导致社会交往能力的缺乏，甚至对待人就像对待无生命的物体，常错误理解别人有意识的行为。

3、脑器质性损害：如产伤、宫内窒息、中毒、感染等，14%～50%的患儿伴癫痫发作、脑电图异常、脑CT、磁共振有非特异性改变。有的伴有神经系统体征、躯体畸形等。先天性风疹病毒感染、巨细胞病毒感染均可能与自闭症发病有关。这些先天性的损伤会对孩子的未来产生非常大的影响，通常都是不利的。

4、神经内分泌和神经递质：儿童行为与神经递质密切相关。有研究资料认为中枢神经系统5-羟色胺和或多巴胺活性下降。伴有下丘脑功能障碍则可产生自闭症。也有认为本症表现孤独、与别人建立不起感情等症状是因脑内啡呔类物质的神经递质作用异常所致。自闭症患儿普遍表现为语言能力和认知能力等方面的发育障碍，不敢与他人视线进行接触，既不表露感情，也不理解感情，对每一件事都非常执着等。

4、社会发展环境和信息污染：在一系列被称为“现代病”的名单中，自闭症位居前列，目前自闭症儿童日趋增多的罪魁祸首之一。人类被信息包围、淹没，造成一部分人在潜意识里对信息的排斥和对人际交流的厌倦，从而“影射”到了后代身上。而社会竞争的加剧、生存压力的加大，导致家庭没有亲情爱意，也是自闭症的一大诱因。

5、与生物体本身有关：经过5年的研究，在染色体上发现了导致儿童自闭症的切面。这一发现为彻底解开自闭症之谜，为预防和治疗自闭症带来了新的希望。至今，一直观察不到自闭症儿童的大脑发育和活动情况。

6、家庭气氛紧张让孩子备感冷落：据统计，目前，儿童患自闭症的人数是以往的3.5倍左右。这与家长工作紧张，无暇陪伴孩子或对孩子表现得急躁、缺乏耐心有关。儿童自闭症过去的发病率为千分之二左右，现在为千分之七左右。患自闭症的儿童多有语言障碍、多动、不合群等。

7、脑伤引起：脑伤包括在怀孕期间窘迫性流产等因素而造成大脑发育不全，生产过程中早产、难产、新生儿脑伤，以及婴儿其因感染脑炎、脑膜炎等疾病造成脑部伤害等因素，都可能增加自闭症机会。

8、代谢疾病：新陈代谢疾病如苯酮尿症等先天的新陈代谢障碍，造成脑细胞的功能失调和障碍，会影响脑神经讯息传递的功能，而造成自闭症。